Πολύ συχνό φαινόμενο είναι να ξυπνούν με πονοκέφαλο τα άτομα που πάσχουν από υπνική άπνοια, μια διαταραχή του ύπνου που χαρακτηρίζεται επεισόδια προσωρινή διακοπής της αναπνοής. Η υπνική άπνοια διαγιγνώσκεται με τη βοήθεια ειδικής εξέτασης.
Συχνά, πολλοί άνθρωποι ξυπνούν με πονοκέφαλο και όπως είναι φυσικό, χαλασμένη διάθεση. Αν και συνήθως μπορεί να είναι αποτέλεσμα της κατανάλωσης αλκοόλ από το προηγούμενο βράδυ, δεν είναι μόνο αυτή η αιτία.
Πολύ συχνό φαινόμενο είναι να ξυπνούν με πονοκέφαλο τα άτομα που πάσχουν από υπνική άπνοια, μια διαταραχή του ύπνου που χαρακτηρίζεται επεισόδια προσωρινή διακοπής της αναπνοής. Η υπνική άπνοια διαγιγνώσκεται με τη βοήθεια ειδικής εξέτασης.